Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HPSEQ9Y251 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms