Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms