Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P0C879 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P0C879 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P0C879 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P0C879 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P0C879 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P0C879 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P0C879 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P0C879 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P0C879 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P0C879 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P0C879 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P0C879 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P0C879 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P0C879 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P0C879 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P0C879 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P0C879 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms