Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms