Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CDC27-216ENST00000574304 514 ntTSL 59.39□□□□□ -0.915e-7■■■■□ 21.2
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-213ENST00000611963 739 ntTSL 58.78□□□□□ -11e-9■■■■□ 21.2
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-216ENST00000614494 515 ntTSL 57.7□□□□□ -1.181e-9■■■■□ 21.2
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-208ENST00000477447 409 ntTSL 56.13□□□□□ -1.431e-9■■■■□ 21.2
UTP3Q9NQZ2 AL662899.3-202ENST00000617558 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 SRRM1-220ENST00000496882 834 ntTSL 58.3□□□□□ -1.081e-7■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-217ENST00000510984 505 ntTSL 317.13■□□□□ 0.336e-7■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-206ENST00000504563 840 ntTSL 515.2■□□□□ 0.026e-7■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-207ENST00000505619 658 ntTSL 313.82□□□□□ -0.26e-7■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-213ENST00000508218 533 ntTSL 213.21□□□□□ -0.296e-7■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.296e-7■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-209ENST00000506686 582 ntTSL 412.96□□□□□ -0.336e-7■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-215ENST00000509335 582 ntTSL 212.96□□□□□ -0.336e-7■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.725e-8■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.375e-8■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.35e-8■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.345e-8■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.475e-8■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.565e-8■■■■□ 21.1
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-207ENST00000578134 831 ntTSL 318.13■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-213ENST00000579605 560 ntTSL 413.94□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-222ENST00000581708 543 ntTSL 413.28□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-204ENST00000577664 568 ntTSL 411.84□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-214ENST00000579632 738 ntTSL 411.29□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-227ENST00000583352 901 ntTSL 310.21□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-208ENST00000578525 564 ntTSL 410.04□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-220ENST00000581160 490 ntTSL 39.83□□□□□ -0.842e-6■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 FLNA-209ENST00000444578 843 ntTSL 317.69■□□□□ 0.427e-7■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-10■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 LRBA-208ENST00000510157 1636 ntTSL 515.76■□□□□ 0.112e-10■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 LRBA-206ENST00000508606 633 ntTSL 313.68□□□□□ -0.222e-10■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.082e-10■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 LRBA-213ENST00000515096 2914 ntTSL 1 (best)8.16□□□□□ -1.12e-10■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.242e-10■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 DIAPH1-207ENST00000472516 508 ntTSL 25.92□□□□□ -1.462e-10■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.828e-9■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-204ENST00000570705 675 ntTSL 316.41■□□□□ 0.228e-9■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-206ENST00000571041 498 ntTSL 416.13■□□□□ 0.178e-9■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.128e-9■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 SLC25A3-207ENST00000547869 1018 ntTSL 211.99□□□□□ -0.498e-9■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-227ENST00000576674 593 ntTSL 48.39□□□□□ -1.078e-9■■■■□ 21
UTP3Q9NQZ2 PYCR2-202ENST00000446534 1341 ntTSL 216.44■□□□□ 0.224e-6■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-202ENST00000464363 764 ntTSL 218.61■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-203ENST00000471621 902 ntTSL 216.9■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 NELFCD-211ENST00000492016 606 ntTSL 216.9■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 PCM1-204ENST00000517730 2536 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.24e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.14e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-211ENST00000592700 1602 ntTSL 221.44■■□□□ 1.024e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.924e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.444e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.444e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.24e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.24e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.24e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.24e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.194e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-204ENST00000586656 436 ntTSL 315.91■□□□□ 0.144e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 RPS15-213ENST00000617694 338 ntTSL 312.16□□□□□ -0.464e-12■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 AC004674.1-201ENST00000458400 739 ntBASIC12.09□□□□□ -0.478e-7■■■■□ 20.9
UTP3Q9NQZ2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM263-209ENST00000551813 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 HERC4-212ENST00000505760 578 ntTSL 426.12■■□□□ 1.773e-11■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 OS9-208ENST00000546916 1028 ntTSL 221.74■■□□□ 1.073e-11■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-212ENST00000564659 854 ntTSL 216.77■□□□□ 0.283e-11■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-208ENST00000562957 397 ntTSL 210.34□□□□□ -0.753e-11■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 HERC4-203ENST00000395185 625 ntTSL 49□□□□□ -0.973e-11■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.193e-11■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 CHD1L-206ENST00000469625 423 ntTSL 56.49□□□□□ -1.376e-7■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 CHD1L-207ENST00000485113 377 ntTSL 35.82□□□□□ -1.486e-7■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 PHIP-202ENST00000479165 5694 ntTSL 1 (best)2.71□□□□□ -1.981e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 MPP1-201ENST00000369531 519 ntTSL 313.62□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 WAC-212ENST00000448193 506 ntTSL 228.34■■■□□ 2.134e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 WAC-211ENST00000442148 759 ntTSL 520.71■□□□□ 0.914e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 WAC-207ENST00000420266 784 ntTSL 514.79□□□□□ -0.044e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 WAC-208ENST00000424454 1330 ntTSL 27.26□□□□□ -1.254e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 WAC-206ENST00000414108 816 ntTSL 36.88□□□□□ -1.314e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.394e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 WAC-201ENST00000345541 4526 ntTSL 1 (best)5.16□□□□□ -1.584e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 WAC-210ENST00000439676 2762 ntTSL 55.13□□□□□ -1.594e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.684e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-203ENST00000505243 614 ntTSL 319.89■□□□□ 0.776e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.416e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-202ENST00000503002 480 ntTSL 314.7□□□□□ -0.066e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-207ENST00000508783 587 ntTSL 313.73□□□□□ -0.216e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.846e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-214ENST00000515818 572 ntTSL 59.81□□□□□ -0.846e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-206ENST00000507485 1526 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.886e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-211ENST00000512797 686 ntTSL 29.11□□□□□ -0.956e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.016e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.46e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.46e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-213ENST00000515792 671 ntTSL 36.32□□□□□ -1.46e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-205ENST00000507327 674 ntTSL 26□□□□□ -1.456e-15■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)31.19■■■□□ 2.588e-7■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.53e-6■■■■□ 20.8
UTP3Q9NQZ2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 20.8
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