RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505760.5

HERC4-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 4

Gene HERC4, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-212ENST00000505760 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.53■■■■■ 7.44
HERC4-212ENST00000505760 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.17■■■■■ 6.42
HERC4-212ENST00000505760 ABCC9O60706 1549 aa55■■■■■ 6.4
HERC4-212ENST00000505760 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.45■■■■■ 5.99
HERC4-212ENST00000505760 NACADO15069 1562 aa52.11■■■■■ 5.93
HERC4-212ENST00000505760 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.95■■■■■ 5.91
HERC4-212ENST00000505760 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.42■■■■■ 5.82
HERC4-212ENST00000505760 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.38■■■■■ 5.82
HERC4-212ENST00000505760 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.27■■■■■ 5.8
HERC4-212ENST00000505760 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.23■■■■■ 5.79
HERC4-212ENST00000505760 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.02■■■■■ 5.76
HERC4-212ENST00000505760 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.85■■■■■ 5.73
HERC4-212ENST00000505760 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.82■■■■■ 5.73
HERC4-212ENST00000505760 SCRIBQ14160 1630 aa50.29■■■■■ 5.64
HERC4-212ENST00000505760 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.21■■■■■ 5.63
HERC4-212ENST00000505760 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.7■■■■■ 5.55
HERC4-212ENST00000505760 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.63■■■■■ 5.54
HERC4-212ENST00000505760 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.53■■■■■ 5.52
HERC4-212ENST00000505760 NCAPD3P42695 1498 aa48.08■■■■■ 5.29
HERC4-212ENST00000505760 SMARCA4P51532 1647 aa47.98■■■■■ 5.27
HERC4-212ENST00000505760 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.96■■■■■ 5.27
HERC4-212ENST00000505760 SMARCA2P51531 1590 aa47.88■■■■■ 5.25
HERC4-212ENST00000505760 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
HERC4-212ENST00000505760 HMGXB3Q12766 1538 aa47.76■■■■■ 5.24
HERC4-212ENST00000505760 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
HERC4-212ENST00000505760 ERCC6Q03468 1493 aa47.53■■■■■ 5.2
HERC4-212ENST00000505760 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.49■■■■■ 5.19
HERC4-212ENST00000505760 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.41■■■■■ 5.18
HERC4-212ENST00000505760 CUX2O14529 1486 aa47.33■■■■■ 5.17
HERC4-212ENST00000505760 NESP48681 1621 aa47.28■■■■■ 5.16
HERC4-212ENST00000505760 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.1■■■■■ 5.13
HERC4-212ENST00000505760 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.01■■■■■ 5.12
HERC4-212ENST00000505760 WIZO95785 1651 aa46.87■■■■■ 5.09
HERC4-212ENST00000505760 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
HERC4-212ENST00000505760 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.74■■■■■ 5.07
HERC4-212ENST00000505760 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.72■■■■■ 5.07
HERC4-212ENST00000505760 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.64■■■■■ 5.06
HERC4-212ENST00000505760 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
HERC4-212ENST00000505760 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.31■■■■■ 5
HERC4-212ENST00000505760 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.28■■■■■ 5
HERC4-212ENST00000505760 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.18■■■■■ 4.98
HERC4-212ENST00000505760 WDR62O43379 1518 aa46.18■■■■■ 4.98
HERC4-212ENST00000505760 CFTRP13569 1480 aa46.14■■■■■ 4.98
HERC4-212ENST00000505760 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.12■■■■■ 4.97
HERC4-212ENST00000505760 PRDM2Q13029 1718 aa45.76■■■■■ 4.92
HERC4-212ENST00000505760 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.75■■■■■ 4.91
HERC4-212ENST00000505760 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
HERC4-212ENST00000505760 TOPBP1Q92547 1522 aa45.26■■■■■ 4.84
HERC4-212ENST00000505760 IFT140Q96RY7 1462 aa45.23■■■■■ 4.83
HERC4-212ENST00000505760 OSCARQ8IYS5 282 aa45.22■■■■■ 4.83
HERC4-212ENST00000505760 ABCC8Q09428 1581 aa45.2■■■■■ 4.83
HERC4-212ENST00000505760 TRIM41Q8WV44 630 aa45.16■■■■■ 4.82
HERC4-212ENST00000505760 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.13■■■■■ 4.82
HERC4-212ENST00000505760 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.12■■■■■ 4.81
HERC4-212ENST00000505760 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
HERC4-212ENST00000505760 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
HERC4-212ENST00000505760 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.81■■■■■ 4.76
HERC4-212ENST00000505760 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.76■■■■■ 4.76
HERC4-212ENST00000505760 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.65■■■■■ 4.74
HERC4-212ENST00000505760 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.74
HERC4-212ENST00000505760 SOGA1O94964 1423 aa44.62■■■■■ 4.73
HERC4-212ENST00000505760 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.61■■■■■ 4.73
HERC4-212ENST00000505760 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.61■■■■■ 4.73
HERC4-212ENST00000505760 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.61■■■■■ 4.73
HERC4-212ENST00000505760 CHD1O14646 1710 aa44.57■■■■■ 4.73
HERC4-212ENST00000505760 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.56■■■■■ 4.72
HERC4-212ENST00000505760 CUX1P39880 1505 aa44.54■■■■■ 4.72
HERC4-212ENST00000505760 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
HERC4-212ENST00000505760 FBLN2P98095 1184 aa44.49■■■■■ 4.71
HERC4-212ENST00000505760 ARHGEF11O15085 1522 aa44.47■■■■■ 4.71
HERC4-212ENST00000505760 WDR97A6NE52 1622 aa44.42■■■■■ 4.7
HERC4-212ENST00000505760 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.31■■■■■ 4.68
HERC4-212ENST00000505760 GRIN2BQ13224 1484 aa44.22■■■■■ 4.67
HERC4-212ENST00000505760 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
HERC4-212ENST00000505760 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
HERC4-212ENST00000505760 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.16■■■■■ 4.66
HERC4-212ENST00000505760 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.09■■■■■ 4.65
HERC4-212ENST00000505760 PBRM1Q86U86 1689 aa44.09■■■■■ 4.65
HERC4-212ENST00000505760 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.06■■■■■ 4.64
HERC4-212ENST00000505760 SYNJ2O15056 1496 aa44.06■■■■■ 4.64
HERC4-212ENST00000505760 SYNJ1O43426 1573 aa44.05■■■■■ 4.64
HERC4-212ENST00000505760 ARAP1Q96P48 1450 aa44.03■■■■■ 4.64
HERC4-212ENST00000505760 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.01■■■■■ 4.64
HERC4-212ENST00000505760 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.98■■■■■ 4.63
HERC4-212ENST00000505760 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.95■■■■■ 4.63
HERC4-212ENST00000505760 TOP2BQ02880 1626 aa43.89■■■■■ 4.62
HERC4-212ENST00000505760 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.89■■■■■ 4.62
HERC4-212ENST00000505760 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
HERC4-212ENST00000505760 GRIN2AQ12879 1464 aa43.64■■■■■ 4.58
HERC4-212ENST00000505760 ADAMTS12P58397 1594 aa43.64■■■■■ 4.58
HERC4-212ENST00000505760 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.53■■■■■ 4.56
HERC4-212ENST00000505760 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.53■■■■■ 4.56
HERC4-212ENST00000505760 CEP170Q5SW79 1584 aa43.47■■■■■ 4.55
HERC4-212ENST00000505760 NUP160Q12769 1436 aa43.47■■■■■ 4.55
HERC4-212ENST00000505760 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.34■■■■■ 4.53
HERC4-212ENST00000505760 SHROOM2Q13796 1616 aa43.27■■■■■ 4.52
HERC4-212ENST00000505760 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
HERC4-212ENST00000505760 JPH4Q96JJ6 628 aa43.06■■■■■ 4.48
HERC4-212ENST00000505760 KIF27Q86VH2 1401 aa43.05■■■■■ 4.48
HERC4-212ENST00000505760 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.02■■■■■ 4.48
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