Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms