Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SQSTM1-204ENST00000453046 572 ntTSL 421.95■■□□□ 1.11e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SQSTM1-209ENST00000504627 602 ntTSL 521.95■■□□□ 1.11e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SQSTM1-212ENST00000508284 578 ntTSL 421.95■■□□□ 1.11e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.81e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.581e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SQSTM1-205ENST00000464493 532 ntTSL 417.6■□□□□ 0.411e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SQSTM1-207ENST00000481335 562 ntTSL 414.82□□□□□ -0.041e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SQSTM1-203ENST00000422245 628 ntTSL 414.14□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC8.49□□□□□ -1.056e-38■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.69□□□□□ -2.143e-56■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.673e-9■□□□□ 10.1
AATFQ9NY61 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.655e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.595e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.715e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 FADS3-210ENST00000531956 841 ntTSL 518.22■□□□□ 0.515e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 FADS3-206ENST00000527379 768 ntTSL 318.16■□□□□ 0.55e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 FADS3-208ENST00000529404 2379 ntTSL 217.37■□□□□ 0.375e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 FADS3-211ENST00000533676 5314 ntTSL 216.8■□□□□ 0.285e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 FADS3-212ENST00000534223 800 ntTSL 516.07■□□□□ 0.165e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.583e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.583e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 ARL15-206ENST00000510591 804 ntTSL 54.04□□□□□ -1.763e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 211.03□□□□□ -0.641e-323■□□□□ 10
AATFQ9NY61 EIF4A2-209ENST00000461021 575 ntTSL 25.33□□□□□ -1.561e-323■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.451e-323■□□□□ 10
AATFQ9NY61 RPS28-202ENST00000449223 1523 ntTSL 223.03■■□□□ 1.281e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 222.43■■□□□ 1.181e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SLC2A1-206ENST00000625233 1031 ntTSL 221.8■■□□□ 1.081e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.081e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEMA4C-205ENST00000474420 2625 ntTSL 221.46■■□□□ 1.031e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 319.32■□□□□ 0.681e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.661e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 RPS28-201ENST00000417088 334 ntTSL 218.19■□□□□ 0.51e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.411e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 517.58■□□□□ 0.411e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SLC2A1-209ENST00000630821 591 ntTSL 217.52■□□□□ 0.41e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEMA4C-204ENST00000467747 3371 ntTSL 216.44■□□□□ 0.221e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 RPS28-204ENST00000602140 912 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.181e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 TFRC-204ENST00000421258 524 ntTSL 315.89■□□□□ 0.135e-12■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.181e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-6■□□□□ 10
AATFQ9NY61 TFRC-208ENST00000464011 546 ntTSL 412.84□□□□□ -0.355e-12■□□□□ 10
AATFQ9NY61 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.664e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 CDV3-204ENST00000503932 563 ntTSL 426.19■■□□□ 1.784e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.154e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 HDAC7-217ENST00000459625 6414 ntTSL 217.98■□□□□ 0.474e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 HDAC7-222ENST00000477937 410 ntTSL 516.84■□□□□ 0.294e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.284e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 HDAC7-221ENST00000477203 3122 ntTSL 215.68■□□□□ 0.14e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 HDAC7-219ENST00000470668 4266 ntTSL 215.57■□□□□ 0.084e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 HDAC7-228ENST00000548938 2719 ntTSL 515.53■□□□□ 0.084e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 04e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 04e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.084e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.194e-7■□□□□ 10
AATFQ9NY61 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.487e-8■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 GS1-600G8.3-201ENST00000431486 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-6■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.673e-9■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.961e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-216ENST00000641834 1718 nt20.15■□□□□ 0.821e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.521e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-203ENST00000593287 578 ntTSL 516.56■□□□□ 0.241e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-206ENST00000596554 727 ntTSL 315.96■□□□□ 0.151e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-210ENST00000598463 1844 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.131e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-209ENST00000597705 892 ntTSL 315.37■□□□□ 0.051e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-213ENST00000601267 782 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-208ENST00000597493 971 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-211ENST00000599004 866 ntTSL 514.63□□□□□ -0.071e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-204ENST00000595794 941 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.271e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 SNORD88C-201ENST00000408061 91 ntBASIC12.15□□□□□ -0.461e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 C19orf48-214ENST00000602125 292 ntTSL 55.77□□□□□ -1.491e-323■□□□□ 9.9
AATFQ9NY61 ANO9-207ENST00000532094 5487 ntTSL 219.69■□□□□ 0.742e-8■□□□□ 9.8
AATFQ9NY61 ANO9-206ENST00000528927 2639 ntTSL 1 (best)18.55■□□□□ 0.562e-8■□□□□ 9.8
AATFQ9NY61 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-8■□□□□ 9.8
AATFQ9NY61 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.122e-7■□□□□ 9.8
AATFQ9NY61 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 426.72■■□□□ 1.871e-22■□□□□ 9.8
AATFQ9NY61 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.41e-323■□□□□ 9.8
AATFQ9NY61 MFGE8-206ENST00000558029 849 ntTSL 321.09■□□□□ 0.974e-8■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 CUL4A-211ENST00000498562 790 ntTSL 331.76■■■□□ 2.671e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 CUL4A-205ENST00000463426 893 ntTSL 331.48■■■□□ 2.631e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.481e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.111e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)28.1■■■□□ 2.091e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)28.1■■■□□ 2.091e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 CUL4A-210ENST00000494985 292 ntTSL 528.08■■■□□ 2.091e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.051e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 ARFGAP1-214ENST00000520485 1548 ntTSL 227.68■■■□□ 2.021e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.981e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 522.05■■□□□ 1.121e-6■□□□□ 9.7
AATFQ9NY61 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)22.02■■□□□ 1.111e-6■□□□□ 9.7
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