Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBM42Q9BTD8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms