Protein–RNA interactions for Protein: Q76EJ3

SLC35D2, UDP-N-acetylglucosamine/UDP-glucose/GDP-mannose transporter, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35D2Q76EJ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC35D2Q76EJ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC35D2Q76EJ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms