Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 ANXA1-207ENST00000491192 1400 ntTSL 1 (best)6.67□□□□□ -1.341e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.523e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.093e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.113e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.233e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.213e-10■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 HTATSF1-203ENST00000448450 1014 ntTSL 526.7■■□□□ 1.861e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-12■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 CLNS1A-207ENST00000527133 667 ntTSL 314.61□□□□□ -0.072e-12■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 CHD4-208ENST00000540960 892 ntTSL 59.7□□□□□ -0.861e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.273e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 GGNBP2-218ENST00000620927 680 ntTSL 27.04□□□□□ -1.283e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 GGNBP2-213ENST00000615952 665 ntTSL 35.76□□□□□ -1.493e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 RALBP1-202ENST00000383432 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 SF3B6-201ENST00000233468 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-10■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 511.99□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 IVNS1ABP-207ENST00000480769 3776 ntTSL 1 (best)3.52□□□□□ -1.851e-6■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 HDLBP-202ENST00000373292 3297 ntTSL 510.5□□□□□ -0.735e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CLTC-209ENST00000498711 2941 ntTSL 1 (best)3.68□□□□□ -1.823e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.896e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 GADD45A-203ENST00000460575 874 ntTSL 223.91■■□□□ 1.426e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.236e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.166e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 PAIP2-203ENST00000507415 423 ntTSL 315.9■□□□□ 0.145e-14■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 315.4■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.689e-10■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.69e-10■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 LSM7-202ENST00000585395 621 ntTSL 324.61■■□□□ 1.539e-10■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.59e-10■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.173e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.787e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.743e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.483e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.447e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.327e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.017e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 LSM7-207ENST00000591745 543 ntTSL 214.46□□□□□ -0.099e-10■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.13e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RELA-220ENST00000532999 1341 ntTSL 514.17□□□□□ -0.147e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RELA-208ENST00000526283 2004 ntTSL 513.12□□□□□ -0.317e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RELA-205ENST00000525693 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.717e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 GABRE-204ENST00000462018 650 ntTSL 39.85□□□□□ -0.839e-10■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RELA-217ENST00000531484 2251 ntTSL 29.74□□□□□ -0.857e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 GABRE-210ENST00000489333 592 ntTSL 28.19□□□□□ -1.19e-10■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 LARS-215ENST00000514104 509 ntTSL 26.82□□□□□ -1.321e-17■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CPOX-205ENST00000515041 1030 ntTSL 224.83■■□□□ 1.572e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CPOX-204ENST00000513674 826 ntTSL 524.21■■□□□ 1.472e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.052e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.395e-22■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.165e-22■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.233e-11■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 NUCB2-209ENST00000529313 937 ntTSL 515.62■□□□□ 0.093e-11■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 NUCB2-210ENST00000530527 1837 ntTSL 28.18□□□□□ -1.13e-11■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CDK1-203ENST00000395284 1913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.113e-11■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CDK1-207ENST00000519078 723 ntTSL 36.38□□□□□ -1.393e-11■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.43e-11■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.553e-11■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CLTC-207ENST00000483176 760 ntTSL 35.17□□□□□ -1.583e-11■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.683e-11■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.042e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.412e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.72e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-10■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 NOP53-204ENST00000595143 810 ntTSL 520.95■□□□□ 0.944e-9■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 NOP53-205ENST00000597985 656 ntTSL 316.19■□□□□ 0.184e-9■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 DNM2-219ENST00000591818 538 ntTSL 413.31□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.932e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.722e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.022e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 MCM4-212ENST00000521151 1125 ntTSL 29.86□□□□□ -0.836e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.641e-30■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -01e-30■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RPL19-201ENST00000225430 732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71e-30■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 RPL19-205ENST00000579374 690 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71e-30■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 INCENP-206ENST00000533896 570 ntTSL 415.96■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 SUPT5H-217ENST00000599907 859 ntTSL 411.64□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 NOP53-203ENST00000594525 876 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.377e-9■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 CIZ1-218ENST00000476727 1205 ntTSL 519.07■□□□□ 0.641e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.118e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.148e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.848e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-215ENST00000568339 2271 ntTSL 215.7■□□□□ 0.18e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.18e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-206ENST00000564544 617 ntTSL 315.07■□□□□ 08e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.258e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-204ENST00000562929 452 ntTSL 511.82□□□□□ -0.528e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-211ENST00000566405 490 ntTSL 511.11□□□□□ -0.638e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-217ENST00000569997 3946 nt8.9□□□□□ -0.998e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 COX4I1-207ENST00000564648 1235 ntTSL 58.75□□□□□ -1.018e-8■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.943e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 314.27□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.699e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.599e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.539e-7■■□□□ 12.5
PUM1Q14671 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.519e-7■■□□□ 12.5
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