Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNASE1L3Q13609 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNASE1L3Q13609 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms