Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SCGB2A2Q13296 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SCGB2A2Q13296 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SCGB2A2Q13296 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SCGB2A2Q13296 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCGB2A2Q13296 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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