Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 25.9
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TARDBPQ13148 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 25.9
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TARDBPQ13148 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -17e-8■■■■□ 25.8
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TARDBPQ13148 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.952e-7■■■■□ 25.8
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TARDBPQ13148 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 517.8■□□□□ 0.446e-8■■■■□ 25.8
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TARDBPQ13148 MIB2-230ENST00000514363 592 ntTSL 316.73■□□□□ 0.276e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.266e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.216e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.216e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 SHISA5-218ENST00000497863 972 ntTSL 216.25■□□□□ 0.196e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.146e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.136e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.126e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.116e-8■■■■□ 25.8
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TARDBPQ13148 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 214.89□□□□□ -0.036e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.046e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 SHISA5-216ENST00000494854 1908 ntTSL 1 (best)14.53□□□□□ -0.086e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.16e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 SYTL1-202ENST00000473280 312 ntTSL 314.4□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 25.8
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