RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507082.1

MIB2-221, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 2

Gene MIB2, Length 1,578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-221ENST00000507082 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.47■■■■■ 7.11
MIB2-221ENST00000507082 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.76■■■■■ 6.04
MIB2-221ENST00000507082 ABCC9O60706 1549 aa51.51■■■■■ 5.84
MIB2-221ENST00000507082 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.67■■■■■ 5.54
MIB2-221ENST00000507082 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.58■■■■■ 5.53
MIB2-221ENST00000507082 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.56■■■■■ 5.52
MIB2-221ENST00000507082 NACADO15069 1562 aa49.52■■■■■ 5.52
MIB2-221ENST00000507082 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.23■■■■■ 5.47
MIB2-221ENST00000507082 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.13■■■■■ 5.46
MIB2-221ENST00000507082 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.57■■■■■ 5.37
MIB2-221ENST00000507082 SCRIBQ14160 1630 aa48.26■■■■■ 5.32
MIB2-221ENST00000507082 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.17■■■■■ 5.3
MIB2-221ENST00000507082 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.12■■■■■ 5.29
MIB2-221ENST00000507082 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.45■■■■■ 5.19
MIB2-221ENST00000507082 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.1■■■■■ 5.13
MIB2-221ENST00000507082 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
MIB2-221ENST00000507082 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.59■■■■■ 5.05
MIB2-221ENST00000507082 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.37■■■■■ 5.01
MIB2-221ENST00000507082 SMARCA4P51532 1647 aa46.13■■■■■ 4.97
MIB2-221ENST00000507082 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
MIB2-221ENST00000507082 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.89■■■■■ 4.94
MIB2-221ENST00000507082 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.79■■■■■ 4.92
MIB2-221ENST00000507082 SMARCA2P51531 1590 aa45.72■■■■■ 4.91
MIB2-221ENST00000507082 NCAPD3P42695 1498 aa45.69■■■■■ 4.9
MIB2-221ENST00000507082 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.61■■■■■ 4.89
MIB2-221ENST00000507082 HMGXB3Q12766 1538 aa45.5■■■■■ 4.87
MIB2-221ENST00000507082 WIZO95785 1651 aa45.45■■■■■ 4.87
MIB2-221ENST00000507082 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
MIB2-221ENST00000507082 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.4■■■■■ 4.86
MIB2-221ENST00000507082 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
MIB2-221ENST00000507082 NESP48681 1621 aa44.66■■■■■ 4.74
MIB2-221ENST00000507082 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
MIB2-221ENST00000507082 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.47■■■■■ 4.71
MIB2-221ENST00000507082 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.39■■■■■ 4.7
MIB2-221ENST00000507082 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.39■■■■■ 4.7
MIB2-221ENST00000507082 ERCC6Q03468 1493 aa44.33■■■■■ 4.69
MIB2-221ENST00000507082 CFTRP13569 1480 aa44.18■■■■■ 4.66
MIB2-221ENST00000507082 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.15■■■■■ 4.66
MIB2-221ENST00000507082 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.13■■■■■ 4.66
MIB2-221ENST00000507082 PRDM2Q13029 1718 aa43.93■■■■■ 4.62
MIB2-221ENST00000507082 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.91■■■■■ 4.62
MIB2-221ENST00000507082 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
MIB2-221ENST00000507082 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.83■■■■■ 4.61
MIB2-221ENST00000507082 CUX2O14529 1486 aa43.71■■■■■ 4.59
MIB2-221ENST00000507082 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.71■■■■■ 4.59
MIB2-221ENST00000507082 WDR62O43379 1518 aa43.57■■■■■ 4.57
MIB2-221ENST00000507082 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
MIB2-221ENST00000507082 TOPBP1Q92547 1522 aa43.25■■■■■ 4.51
MIB2-221ENST00000507082 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.21■■■■■ 4.51
MIB2-221ENST00000507082 ABCC8Q09428 1581 aa43.15■■■■■ 4.5
MIB2-221ENST00000507082 CUX1P39880 1505 aa43.03■■■■■ 4.48
MIB2-221ENST00000507082 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
MIB2-221ENST00000507082 IFT140Q96RY7 1462 aa42.87■■■■■ 4.45
MIB2-221ENST00000507082 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.84■■■■■ 4.45
MIB2-221ENST00000507082 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.79■■■■■ 4.44
MIB2-221ENST00000507082 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
MIB2-221ENST00000507082 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
MIB2-221ENST00000507082 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.75■■■■■ 4.43
MIB2-221ENST00000507082 SYNJ1O43426 1573 aa42.75■■■■■ 4.43
MIB2-221ENST00000507082 SOGA1O94964 1423 aa42.71■■■■■ 4.43
MIB2-221ENST00000507082 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.7■■■■■ 4.43
MIB2-221ENST00000507082 TOP2BQ02880 1626 aa42.69■■■■■ 4.42
MIB2-221ENST00000507082 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
MIB2-221ENST00000507082 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.52■■■■■ 4.4
MIB2-221ENST00000507082 WDR97A6NE52 1622 aa42.5■■■■■ 4.39
MIB2-221ENST00000507082 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
MIB2-221ENST00000507082 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.38■■■■■ 4.38
MIB2-221ENST00000507082 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.24■■■■■ 4.35
MIB2-221ENST00000507082 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.22■■■■■ 4.35
MIB2-221ENST00000507082 PBRM1Q86U86 1689 aa42.19■■■■■ 4.34
MIB2-221ENST00000507082 GRIN2BQ13224 1484 aa42.16■■■■■ 4.34
MIB2-221ENST00000507082 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.15■■■■■ 4.34
MIB2-221ENST00000507082 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.13■■■■■ 4.33
MIB2-221ENST00000507082 CHD1O14646 1710 aa42.05■■■■■ 4.32
MIB2-221ENST00000507082 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
MIB2-221ENST00000507082 FBLN2P98095 1184 aa41.98■■■■■ 4.31
MIB2-221ENST00000507082 OSCARQ8IYS5 282 aa41.97■■■■■ 4.31
MIB2-221ENST00000507082 TRIM41Q8WV44 630 aa41.93■■■■■ 4.3
MIB2-221ENST00000507082 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.87■■■■■ 4.29
MIB2-221ENST00000507082 SYNJ2O15056 1496 aa41.87■■■■■ 4.29
MIB2-221ENST00000507082 KIF27Q86VH2 1401 aa41.84■■■■■ 4.29
MIB2-221ENST00000507082 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
MIB2-221ENST00000507082 ADAMTS12P58397 1594 aa41.82■■■■■ 4.29
MIB2-221ENST00000507082 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.71■■■■■ 4.27
MIB2-221ENST00000507082 IGF1RP08069 1367 aa41.68■■■■■ 4.26
MIB2-221ENST00000507082 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.66■■■■■ 4.26
MIB2-221ENST00000507082 GRIN2AQ12879 1464 aa41.64■■■■■ 4.26
MIB2-221ENST00000507082 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.59■■■■■ 4.25
MIB2-221ENST00000507082 CUL7Q14999 1698 aa41.56■■■■■ 4.24
MIB2-221ENST00000507082 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.52■■■■■ 4.24
MIB2-221ENST00000507082 CEP170Q5SW79 1584 aa41.48■■■■■ 4.23
MIB2-221ENST00000507082 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.43■■■■■ 4.22
MIB2-221ENST00000507082 NUP160Q12769 1436 aa41.42■■■■■ 4.22
MIB2-221ENST00000507082 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
MIB2-221ENST00000507082 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
MIB2-221ENST00000507082 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
MIB2-221ENST00000507082 ARHGEF11O15085 1522 aa41.34■■■■■ 4.21
MIB2-221ENST00000507082 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.2■■■■■ 4.19
MIB2-221ENST00000507082 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
MIB2-221ENST00000507082 EEA1Q15075 1411 aa41.13■■■■■ 4.18
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