RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473280.1

SYTL1-202, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 3

Gene SYTL1, Length 312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-202ENST00000473280 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.37■■■■□ 3.25
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SYTL1-202ENST00000473280 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.92■■■□□ 2.54
SYTL1-202ENST00000473280 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.64■■■□□ 2.5
SYTL1-202ENST00000473280 NACADO15069 1562 aa30.32■■■□□ 2.45
SYTL1-202ENST00000473280 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.11■■■□□ 2.41
SYTL1-202ENST00000473280 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
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SYTL1-202ENST00000473280 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.87■■■□□ 2.37
SYTL1-202ENST00000473280 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.77■■■□□ 2.36
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SYTL1-202ENST00000473280 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.31■■■□□ 2.28
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SYTL1-202ENST00000473280 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.2■■■□□ 2.27
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SYTL1-202ENST00000473280 SCRIBQ14160 1630 aa29.08■■■□□ 2.25
SYTL1-202ENST00000473280 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.7■■■□□ 2.18
SYTL1-202ENST00000473280 CUX2O14529 1486 aa28.15■■■□□ 2.1
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SYTL1-202ENST00000473280 ERCC6Q03468 1493 aa27.95■■■□□ 2.07
SYTL1-202ENST00000473280 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.85■■■□□ 2.05
SYTL1-202ENST00000473280 HMGXB3Q12766 1538 aa27.77■■■□□ 2.04
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SYTL1-202ENST00000473280 SMARCA4P51532 1647 aa27.72■■■□□ 2.03
SYTL1-202ENST00000473280 SMARCA2P51531 1590 aa27.71■■■□□ 2.03
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SYTL1-202ENST00000473280 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
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SYTL1-202ENST00000473280 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.42■■□□□ 1.98
SYTL1-202ENST00000473280 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.26■■□□□ 1.96
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SYTL1-202ENST00000473280 TRIM41Q8WV44 630 aa27.14■■□□□ 1.94
SYTL1-202ENST00000473280 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.09■■□□□ 1.93
SYTL1-202ENST00000473280 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.08■■□□□ 1.93
SYTL1-202ENST00000473280 WDR62O43379 1518 aa27.08■■□□□ 1.93
SYTL1-202ENST00000473280 WIZO95785 1651 aa26.93■■□□□ 1.9
SYTL1-202ENST00000473280 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.86■■□□□ 1.89
SYTL1-202ENST00000473280 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.79■■□□□ 1.88
SYTL1-202ENST00000473280 CFTRP13569 1480 aa26.72■■□□□ 1.87
SYTL1-202ENST00000473280 OSCARQ8IYS5 282 aa26.7■■□□□ 1.86
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SYTL1-202ENST00000473280 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.54■■□□□ 1.84
SYTL1-202ENST00000473280 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.54■■□□□ 1.84
SYTL1-202ENST00000473280 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.54■■□□□ 1.84
SYTL1-202ENST00000473280 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SYTL1-202ENST00000473280 PRDM2Q13029 1718 aa26.5■■□□□ 1.83
SYTL1-202ENST00000473280 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SYTL1-202ENST00000473280 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SYTL1-202ENST00000473280 ARHGEF11O15085 1522 aa26.37■■□□□ 1.81
SYTL1-202ENST00000473280 IFT140Q96RY7 1462 aa26.34■■□□□ 1.81
SYTL1-202ENST00000473280 TOPBP1Q92547 1522 aa26.26■■□□□ 1.79
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SYTL1-202ENST00000473280 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.22■■□□□ 1.79
SYTL1-202ENST00000473280 CHD1O14646 1710 aa26.17■■□□□ 1.78
SYTL1-202ENST00000473280 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.12■■□□□ 1.77
SYTL1-202ENST00000473280 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SYTL1-202ENST00000473280 ABCC8Q09428 1581 aa26.12■■□□□ 1.77
SYTL1-202ENST00000473280 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.12■■□□□ 1.77
SYTL1-202ENST00000473280 ARAP1Q96P48 1450 aa26.1■■□□□ 1.77
SYTL1-202ENST00000473280 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
SYTL1-202ENST00000473280 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SYTL1-202ENST00000473280 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SYTL1-202ENST00000473280 FBLN2P98095 1184 aa25.87■■□□□ 1.73
SYTL1-202ENST00000473280 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.86■■□□□ 1.73
SYTL1-202ENST00000473280 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.85■■□□□ 1.73
SYTL1-202ENST00000473280 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SYTL1-202ENST00000473280 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.79■■□□□ 1.72
SYTL1-202ENST00000473280 SOGA1O94964 1423 aa25.78■■□□□ 1.72
SYTL1-202ENST00000473280 WDR97A6NE52 1622 aa25.77■■□□□ 1.72
SYTL1-202ENST00000473280 SYNJ1O43426 1573 aa25.72■■□□□ 1.71
SYTL1-202ENST00000473280 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.71■■□□□ 1.71
SYTL1-202ENST00000473280 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
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SYTL1-202ENST00000473280 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
SYTL1-202ENST00000473280 SYNJ2O15056 1496 aa25.61■■□□□ 1.69
SYTL1-202ENST00000473280 PBRM1Q86U86 1689 aa25.58■■□□□ 1.69
SYTL1-202ENST00000473280 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.53■■□□□ 1.68
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SYTL1-202ENST00000473280 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.42■■□□□ 1.66
SYTL1-202ENST00000473280 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.4■■□□□ 1.66
SYTL1-202ENST00000473280 GRIN2AQ12879 1464 aa25.32■■□□□ 1.64
SYTL1-202ENST00000473280 CEP170Q5SW79 1584 aa25.3■■□□□ 1.64
SYTL1-202ENST00000473280 SHROOM2Q13796 1616 aa25.28■■□□□ 1.64
SYTL1-202ENST00000473280 NUP160Q12769 1436 aa25.28■■□□□ 1.64
SYTL1-202ENST00000473280 ADAMTS12P58397 1594 aa25.27■■□□□ 1.64
SYTL1-202ENST00000473280 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.26■■□□□ 1.63
SYTL1-202ENST00000473280 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
SYTL1-202ENST00000473280 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.12■■□□□ 1.61
SYTL1-202ENST00000473280 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.12■■□□□ 1.61
SYTL1-202ENST00000473280 TOP2BQ02880 1626 aa25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-202ENST00000473280 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.07■■□□□ 1.6
SYTL1-202ENST00000473280 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SYTL1-202ENST00000473280 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.96■■□□□ 1.59
SYTL1-202ENST00000473280 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.95■■□□□ 1.58
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