Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 CCT2-203ENST00000544368 1728 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 CCT2-208ENST00000550010 1754 ntTSL 59.88□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ACACA-234ENST00000614482 2177 ntTSL 213.96□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ACACA-245ENST00000619546 5315 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.963e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.243e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.253e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.27□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 SMARCA4-218ENST00000592158 409 ntTSL 213.14□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 CTNNA1-206ENST00000517980 696 ntTSL 422.43■■□□□ 1.183e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 CTNNA1-234ENST00000522227 642 ntTSL 315.44■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 CTNNA1-215ENST00000519309 869 ntTSL 311.34□□□□□ -0.593e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 CTNNA1-240ENST00000523912 545 ntTSL 411.29□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 MUM1-210ENST00000591337 1018 ntTSL 230.4■■■□□ 2.464e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 INPPL1-211ENST00000541544 530 ntTSL 230.14■■■□□ 2.424e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 MUM1-208ENST00000590695 2290 ntTSL 529.28■■■□□ 2.284e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.184e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 228.54■■■□□ 2.164e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 227.71■■■□□ 2.034e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 EHMT1-209ENST00000475704 756 ntTSL 227.08■■□□□ 1.934e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 TRIM65-202ENST00000540128 886 ntTSL 326.94■■□□□ 1.95e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRMT7-227ENST00000569571 959 ntTSL 526.94■■□□□ 1.94e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 226.77■■□□□ 1.884e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 KIF1C-204ENST00000574165 799 ntTSL 526.39■■□□□ 1.824e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)26.25■■□□□ 1.794e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ENOX2-206ENST00000492263 819 ntTSL 326.22■■□□□ 1.794e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ENOX2-205ENST00000432489 1515 ntTSL 1 (best)24.96■■□□□ 1.594e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 TSC22D4-206ENST00000496728 837 ntTSL 324.64■■□□□ 1.544e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.54e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 324.28■■□□□ 1.484e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 POLE-220ENST00000544692 2221 ntTSL 524.25■■□□□ 1.474e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRICKLE3-208ENST00000614014 582 ntTSL 323.98■■□□□ 1.434e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.424e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.414e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 323.79■■□□□ 1.44e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 EHMT1-246ENST00000637748 2006 ntTSL 523.73■■□□□ 1.394e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 MPRIP-217ENST00000581955 868 ntTSL 223.02■■□□□ 1.284e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.254e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ELP6-202ENST00000412761 705 ntTSL 522.76■■□□□ 1.234e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 EHMT1-207ENST00000472849 708 ntTSL 322.51■■□□□ 1.194e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.154e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ELP6-207ENST00000444760 1008 ntTSL 522.15■■□□□ 1.144e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 EHMT1-217ENST00000494249 2038 ntTSL 1 (best)22.02■■□□□ 1.124e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 POLE-206ENST00000534922 1660 ntTSL 322.01■■□□□ 1.114e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.114e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.094e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.084e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.064e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 221.56■■□□□ 1.044e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 WDR46-239ENST00000489905 1007 ntTSL 521.47■■□□□ 1.034e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.984e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 320.87■□□□□ 0.934e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.914e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRMT7-220ENST00000566657 584 ntTSL 220.74■□□□□ 0.914e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 LETM1-202ENST00000466175 1626 ntTSL 220.67■□□□□ 0.94e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)20.65■□□□□ 0.94e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRMT7-214ENST00000565356 1723 ntTSL 520.58■□□□□ 0.884e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRMT7-205ENST00000562050 1005 ntTSL 320.54■□□□□ 0.884e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 NUPL2-207ENST00000485250 2010 ntTSL 520.32■□□□□ 0.844e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 CLIP1-215ENST00000541108 1658 ntTSL 1 (best)20.19■□□□□ 0.824e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.794e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRMT7-212ENST00000564050 846 ntTSL 519.98■□□□□ 0.794e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 EXOSC3-203ENST00000465229 1625 ntTSL 219.95■□□□□ 0.784e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ELP6-208ENST00000445044 1011 ntTSL 319.82■□□□□ 0.764e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PDE3B-205ENST00000534317 5521 ntTSL 1 (best)19.81■□□□□ 0.764e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 519.58■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ELP6-206ENST00000442215 1277 ntTSL 519.54■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 MOB1A-202ENST00000463975 1799 ntTSL 219.42■□□□□ 0.74e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 EXOSC3-205ENST00000482614 462 ntTSL 519.36■□□□□ 0.694e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRICKLE3-203ENST00000432913 990 ntTSL 519.34■□□□□ 0.694e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ATAD3A-205ENST00000429957 498 ntTSL 519.27■□□□□ 0.684e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRMT7-215ENST00000565745 440 ntTSL 519.24■□□□□ 0.674e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ZNF621-207ENST00000490457 916 ntTSL 319.21■□□□□ 0.674e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRMT7-206ENST00000562381 713 ntTSL 219.11■□□□□ 0.654e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.634e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.635e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 EHMT1-208ENST00000475564 2782 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.624e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 MOB1A-203ENST00000488006 482 ntTSL 318.91■□□□□ 0.624e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 LRRFIP1-207ENST00000465870 1626 ntTSL 318.9■□□□□ 0.624e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ACTN1-217ENST00000556203 564 ntTSL 318.84■□□□□ 0.614e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.64e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.594e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 WDR46-233ENST00000461951 669 ntTSL 318.57■□□□□ 0.564e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.564e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.554e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 KAZN-206ENST00000491547 5592 ntTSL 218.38■□□□□ 0.534e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 KDM2B-207ENST00000538243 4110 ntTSL 218.21■□□□□ 0.515e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 ZC3H7A-205ENST00000571198 2343 ntTSL 217.88■□□□□ 0.454e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 LRRFIP1-209ENST00000473815 476 ntTSL 317.6■□□□□ 0.414e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 NUPL2-203ENST00000413919 1329 ntTSL 317.42■□□□□ 0.384e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRMT7-226ENST00000569047 648 ntTSL 517.28■□□□□ 0.364e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.324e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.295e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.294e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.294e-6■■■■□ 21.6
FMR1Q06787 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.284e-6■■■■□ 21.6
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 98.6 ms