Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2BQ00403 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms