Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HADHBP55084 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HADHBP55084 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HADHBP55084 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HADHBP55084 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HADHBP55084 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms