Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD1O95696 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD1O95696 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD1O95696 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD1O95696 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD1O95696 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD1O95696 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD1O95696 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD1O95696 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD1O95696 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD1O95696 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD1O95696 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD1O95696 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD1O95696 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD1O95696 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD1O95696 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD1O95696 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRD1O95696 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD1O95696 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD1O95696 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD1O95696 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD1O95696 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD1O95696 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD1O95696 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD1O95696 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD1O95696 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD1O95696 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms