Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G1

PCDHGB3, Protocadherin gamma-B3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB3Q9Y5G1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGB3Q9Y5G1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGB3Q9Y5G1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGB3Q9Y5G1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGB3Q9Y5G1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGB3Q9Y5G1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGB3Q9Y5G1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms