Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SUPT16HQ9Y5B9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SUPT16HQ9Y5B9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SUPT16HQ9Y5B9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SUPT16HQ9Y5B9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SUPT16HQ9Y5B9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SUPT16HQ9Y5B9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SUPT16HQ9Y5B9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SUPT16HQ9Y5B9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SUPT16HQ9Y5B9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SUPT16HQ9Y5B9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SUPT16HQ9Y5B9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SUPT16HQ9Y5B9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SUPT16HQ9Y5B9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SUPT16HQ9Y5B9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SUPT16HQ9Y5B9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SUPT16HQ9Y5B9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SUPT16HQ9Y5B9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SUPT16HQ9Y5B9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SUPT16HQ9Y5B9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SUPT16HQ9Y5B9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SUPT16HQ9Y5B9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SUPT16HQ9Y5B9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SUPT16HQ9Y5B9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SUPT16HQ9Y5B9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SUPT16HQ9Y5B9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SUPT16HQ9Y5B9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SUPT16HQ9Y5B9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SUPT16HQ9Y5B9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT16HQ9Y5B9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT16HQ9Y5B9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT16HQ9Y5B9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SUPT16HQ9Y5B9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SUPT16HQ9Y5B9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SUPT16HQ9Y5B9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SUPT16HQ9Y5B9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SUPT16HQ9Y5B9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SUPT16HQ9Y5B9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SUPT16HQ9Y5B9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 668.9 ms