Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y580

RBM7, RNA-binding protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM7Q9Y580 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM7Q9Y580 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM7Q9Y580 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM7Q9Y580 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM7Q9Y580 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM7Q9Y580 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM7Q9Y580 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM7Q9Y580 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM7Q9Y580 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM7Q9Y580 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM7Q9Y580 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RBM7Q9Y580 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM7Q9Y580 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms