Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPEF1Q9Y4P9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPEF1Q9Y4P9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPEF1Q9Y4P9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF1Q9Y4P9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPEF1Q9Y4P9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF1Q9Y4P9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPEF1Q9Y4P9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms