Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRELID3BQ9Y3B1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRELID3BQ9Y3B1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRELID3BQ9Y3B1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRELID3BQ9Y3B1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRELID3BQ9Y3B1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRELID3BQ9Y3B1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRELID3BQ9Y3B1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRELID3BQ9Y3B1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRELID3BQ9Y3B1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRELID3BQ9Y3B1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRELID3BQ9Y3B1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRELID3BQ9Y3B1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms