Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP8A1Q9Y2Q0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP8A1Q9Y2Q0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP8A1Q9Y2Q0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP8A1Q9Y2Q0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms