Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A1LQ9UNN4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2A1LQ9UNN4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2A1LQ9UNN4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A1LQ9UNN4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1LQ9UNN4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A1LQ9UNN4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms