Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
L1RE1Q9UN81 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
L1RE1Q9UN81 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
L1RE1Q9UN81 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
L1RE1Q9UN81 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
L1RE1Q9UN81 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
L1RE1Q9UN81 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
L1RE1Q9UN81 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
L1RE1Q9UN81 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
L1RE1Q9UN81 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
L1RE1Q9UN81 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
L1RE1Q9UN81 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
L1RE1Q9UN81 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
L1RE1Q9UN81 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
L1RE1Q9UN81 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
L1RE1Q9UN81 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
L1RE1Q9UN81 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
L1RE1Q9UN81 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms