Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV3

ACIN1, Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACIN1Q9UKV3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ACIN1Q9UKV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
ACIN1Q9UKV3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ACIN1Q9UKV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ACIN1Q9UKV3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ACIN1Q9UKV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
ACIN1Q9UKV3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ACIN1Q9UKV3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ACIN1Q9UKV3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
ACIN1Q9UKV3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
ACIN1Q9UKV3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
ACIN1Q9UKV3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
ACIN1Q9UKV3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
ACIN1Q9UKV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
ACIN1Q9UKV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
ACIN1Q9UKV3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ACIN1Q9UKV3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ACIN1Q9UKV3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
ACIN1Q9UKV3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ACIN1Q9UKV3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
ACIN1Q9UKV3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ACIN1Q9UKV3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ACIN1Q9UKV3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ACIN1Q9UKV3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ACIN1Q9UKV3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ACIN1Q9UKV3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
ACIN1Q9UKV3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
ACIN1Q9UKV3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ACIN1Q9UKV3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
ACIN1Q9UKV3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ACIN1Q9UKV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
ACIN1Q9UKV3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
ACIN1Q9UKV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ACIN1Q9UKV3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
ACIN1Q9UKV3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ACIN1Q9UKV3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ACIN1Q9UKV3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ACIN1Q9UKV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ACIN1Q9UKV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ACIN1Q9UKV3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ACIN1Q9UKV3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ACIN1Q9UKV3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ACIN1Q9UKV3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ACIN1Q9UKV3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ACIN1Q9UKV3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ACIN1Q9UKV3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ACIN1Q9UKV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
ACIN1Q9UKV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
ACIN1Q9UKV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ACIN1Q9UKV3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ACIN1Q9UKV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ACIN1Q9UKV3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ACIN1Q9UKV3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms