Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGFRNQ9P2B2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGFRNQ9P2B2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGFRNQ9P2B2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGFRNQ9P2B2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGFRNQ9P2B2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGFRNQ9P2B2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms