Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALCOCO1Q9P1Z2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms