Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1W8

SIRPG, Signal-regulatory protein gamma, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPGQ9P1W8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRPGQ9P1W8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRPGQ9P1W8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.3 ms