Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1W8

SIRPG, Signal-regulatory protein gamma, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPGQ9P1W8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRPGQ9P1W8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIRPGQ9P1W8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIRPGQ9P1W8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIRPGQ9P1W8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIRPGQ9P1W8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIRPGQ9P1W8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIRPGQ9P1W8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIRPGQ9P1W8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIRPGQ9P1W8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms