Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC59Q9P031 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC59Q9P031 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC59Q9P031 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC59Q9P031 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC59Q9P031 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC59Q9P031 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC59Q9P031 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC59Q9P031 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC59Q9P031 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC59Q9P031 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC59Q9P031 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC59Q9P031 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC59Q9P031 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms