Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF3Q9NR81 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF3Q9NR81 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF3Q9NR81 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF3Q9NR81 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF3Q9NR81 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGEF3Q9NR81 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF3Q9NR81 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF3Q9NR81 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF3Q9NR81 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF3Q9NR81 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF3Q9NR81 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF3Q9NR81 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms