Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL4Q9NR61 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL4Q9NR61 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DLL4Q9NR61 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DLL4Q9NR61 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DLL4Q9NR61 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DLL4Q9NR61 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DLL4Q9NR61 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms