Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC3Q9NQT5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC3Q9NQT5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC3Q9NQT5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC3Q9NQT5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC3Q9NQT5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms