Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCFQ9NPI8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FANCFQ9NPI8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCFQ9NPI8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCFQ9NPI8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCFQ9NPI8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCFQ9NPI8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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