Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CD248Q9HCU0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD248Q9HCU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD248Q9HCU0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD248Q9HCU0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD248Q9HCU0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD248Q9HCU0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD248Q9HCU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms