Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ2

PRDM16, PR domain zinc finger protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16Q9HAZ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRDM16Q9HAZ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM16Q9HAZ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM16Q9HAZ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM16Q9HAZ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM16Q9HAZ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM16Q9HAZ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM16Q9HAZ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM16Q9HAZ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM16Q9HAZ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM16Q9HAZ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM16Q9HAZ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM16Q9HAZ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM16Q9HAZ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRDM16Q9HAZ2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM16Q9HAZ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRDM16Q9HAZ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms