Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00574Q9H8X3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00574Q9H8X3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00574Q9H8X3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00574Q9H8X3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00574Q9H8X3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00574Q9H8X3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00574Q9H8X3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00574Q9H8X3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00574Q9H8X3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms