Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7R0

ZNF442, Zinc finger protein 442, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF442Q9H7R0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF442Q9H7R0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF442Q9H7R0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF442Q9H7R0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF442Q9H7R0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF442Q9H7R0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF442Q9H7R0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF442Q9H7R0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF442Q9H7R0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF442Q9H7R0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF442Q9H7R0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF442Q9H7R0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF442Q9H7R0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF442Q9H7R0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF442Q9H7R0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF442Q9H7R0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF442Q9H7R0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF442Q9H7R0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF442Q9H7R0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF442Q9H7R0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF442Q9H7R0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF442Q9H7R0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF442Q9H7R0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF442Q9H7R0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF442Q9H7R0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF442Q9H7R0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF442Q9H7R0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF442Q9H7R0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF442Q9H7R0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF442Q9H7R0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms