Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD1Q9H4M9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EHD1Q9H4M9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD1Q9H4M9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EHD1Q9H4M9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD1Q9H4M9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms