Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRABDQ9H4I3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRABDQ9H4I3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRABDQ9H4I3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRABDQ9H4I3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRABDQ9H4I3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRABDQ9H4I3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms