Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF18Q99633 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF18Q99633 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF18Q99633 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF18Q99633 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF18Q99633 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF18Q99633 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF18Q99633 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF18Q99633 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF18Q99633 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF18Q99633 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF18Q99633 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF18Q99633 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF18Q99633 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF18Q99633 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF18Q99633 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF18Q99633 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms