Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLF6Q99612 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLF6Q99612 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLF6Q99612 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLF6Q99612 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLF6Q99612 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLF6Q99612 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLF6Q99612 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLF6Q99612 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KLF6Q99612 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLF6Q99612 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLF6Q99612 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLF6Q99612 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLF6Q99612 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLF6Q99612 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLF6Q99612 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLF6Q99612 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KLF6Q99612 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLF6Q99612 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLF6Q99612 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLF6Q99612 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLF6Q99612 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLF6Q99612 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLF6Q99612 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLF6Q99612 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLF6Q99612 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLF6Q99612 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLF6Q99612 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KLF6Q99612 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLF6Q99612 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLF6Q99612 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLF6Q99612 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms