Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PNKPQ96T60 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNKPQ96T60 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNKPQ96T60 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNKPQ96T60 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PNKPQ96T60 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PNKPQ96T60 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PNKPQ96T60 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PNKPQ96T60 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PNKPQ96T60 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PNKPQ96T60 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PNKPQ96T60 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNKPQ96T60 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNKPQ96T60 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNKPQ96T60 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNKPQ96T60 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNKPQ96T60 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PNKPQ96T60 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms