Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NODALQ96S42 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NODALQ96S42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NODALQ96S42 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NODALQ96S42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NODALQ96S42 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NODALQ96S42 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NODALQ96S42 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NODALQ96S42 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NODALQ96S42 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NODALQ96S42 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NODALQ96S42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NODALQ96S42 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NODALQ96S42 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NODALQ96S42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NODALQ96S42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NODALQ96S42 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NODALQ96S42 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NODALQ96S42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NODALQ96S42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NODALQ96S42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NODALQ96S42 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NODALQ96S42 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NODALQ96S42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms