Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF12Q96QT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF12Q96QT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF12Q96QT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF12Q96QT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF12Q96QT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF12Q96QT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms