Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
CCDC7Q96M83 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC7Q96M83 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CCDC7Q96M83 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC7Q96M83 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC7Q96M83 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC7Q96M83 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CCDC7Q96M83 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CCDC7Q96M83 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CCDC7Q96M83 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CCDC7Q96M83 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCDC7Q96M83 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CCDC7Q96M83 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC7Q96M83 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC7Q96M83 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC7Q96M83 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC7Q96M83 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC7Q96M83 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC7Q96M83 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC7Q96M83 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC7Q96M83 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC7Q96M83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC7Q96M83 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms