Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3IP1Q96FE7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3IP1Q96FE7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3IP1Q96FE7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3IP1Q96FE7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3IP1Q96FE7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms